Curriculum Vitae

Elias Romero

Estudiante de Genetica y Biotecnologia (9no ciclo) con foco en bioinformatica, calidad de datos y automatizacion de analisis para investigacion clinica y salud publica.

Experiencia

Experiencia academica en investigacion

2022 - Actualidad | UNMSM, Lima, Peru

Afiliado al Laboratorio de Genomica y Biologia Integrativa.
Cribado, normalizacion y analisis de perfiles de microARNs para biomarcadores de cancer colorrectal en fase pre y post-metastasica.
Mineria de datos y metadatos en GenBank BioProject para seleccionar datasets NGS de Klebsiella pneumoniae MDR.
Analisis in silico de estabilidad estructural del complejo NS3-NS2B del virus del Dengue.

Educacion

Pregrado en Genetica y Biotecnologia - Universidad Nacional Mayor de San Marcos (2022 - actual)
Facultad de Ciencias Biologicas.
Afiliado al Laboratorio de Genomica y Biologia Integrativa.

Habilidades tecnicas

Laboratorio

Cultivo celular de linfocitos, preparacion citologica y evaluacion de calidad de cultivo.
Tecnicas de marcacion: Giemsa, CBG y bandeo G.
Analisis de cariotipo con Adobe Photoshop y software afines.
Extraccion de ADN por columna de silice y evaluacion por nanoespectrofotometria, fluorometria y electroforesis.

In silico y bioinformatica

Python y R: Pandas, NumPy, Matplotlib, Tidyverse, Bioconductor.
APIs y automatizacion con NCBI Entrez Direct/esearch para descargas masivas de metadatos.
SQL avanzado y manejo de formatos estructurados JSON/XML.
Linux y Bash avanzado para servidores remotos y pipelines.
Genomica microbiana: Unicycler, Falcon, Prokka, Bakta, PlasmidFinder, Fastp.
Dinamica molecular y docking: GROMACS, AutoDock Vina, MGLTools.

Certificaciones

Genomica y Metagenomica, secuenciacion y analisis bioinformatico - Flyteek (2024).
II Curso para operadores de Bancos de Tejidos y Celulas - Instituto Nacional de Salud del Nino (2024).
Redaccion y maquetacion de publicaciones academicas mediante LaTeX (nivel intermedio).
Ofimatica avanzada (2022).
Ingles: lectura y escritura intermedio, conversacion basica.

Proyectos desarrollados

AMRplotting (Enfermedades infecciosas)

Flujo de trabajo automatizado para analisis y visualizacion de perfiles de bacterias multidrogorresistentes (MDR).
Habilidades: automatizacion de reportes, manejo de datos genomicos bacterianos y visualizacion en R.

Machine Learning en biomarcadores (Oncologia)

Evaluacion del desempeno predictivo de Random Forest y SVM con perfiles de microARNs.
Habilidades: limpieza de datos de alta dimensionalidad, validacion cruzada y analisis estadistico riguroso.

Publicaciones

Actualmente sin publicaciones indexadas. Participacion activa en proyectos de investigacion con enfoque en microbiologia, oncologia y vigilancia epidemiologica basada en datos omicos.

Contacto

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Afiliacion: Laboratorio de Genomica y Biologia Integrativa, Universidad Nacional Mayor de San Marcos.